數年前，人類以超級戰艦「轟天號」，在南極擊潰「哥吉拉」，並且將「哥吉拉」封印在地底下。但是地球除了「哥吉拉」以外，還有許許多多的怪獸，對各大人類都市虎視眈眈。於是，人類成立了「地球防衛部」，專門對付各種怪獸的入侵。而地球防衛部最強大的成員，就是當年封印哥吉拉的「轟天號」以及其艦長「道格拉斯·戈登上校」。 此外，爲了應付怪獸對人類造成的困擾，地球防衛部特別甄選了有特殊能力的人類，這些「超人類」擁有普通人類所沒有的「M染色體」，讓這些人類擁有比普通人更強大的體能跟敏捷性，以應付怪獸的攻擊，其中的佼佼者就是「尾崎真一少尉」。 就在不久之前，人們挖到一個巨大怪物的遺骸，而且怪物擁有機械跟生物的本質，懷疑能夠將生物跟機械結合起來的怪物應該來自於外太空。不久，尾崎真一收到來自嬰兒島「小美人」的警告，這個怪物是當年被「魔斯拉」給封印的「蓋剛」，蓋剛的出現代表著人類...
數年前，人類以超級戰艦「轟天號」，在南極擊潰「哥吉拉」，並且將「哥吉拉」封印在地底下。但是地球除了「哥吉拉」以外，還有許許多多的怪獸，對各大人類都市虎視眈眈。於是，人類成立了「地球防衛部」，專門對付各種怪獸的入侵。而地球防衛部最強大的成員，就是當年封印哥吉拉的「轟天號」以及其艦長「道格拉斯·戈登上校」。 此外，爲了應付怪獸對人類造成的困擾，地球防衛部特別甄選了有特殊能力的人類，這些「超人類」擁有普通人類所沒有的「M染色體」，讓這些人類擁有比普通人更強大的體能跟敏捷性，以應付怪獸的攻擊，其中的佼佼者就是「尾崎真一少尉」。 就在不久之前，人們挖到一個巨大怪物的遺骸，而且怪物擁有機械跟生物的本質，懷疑能夠將生物跟機械結合起來的怪物應該來自於外太空。不久，尾崎真一收到來自嬰兒島「小美人」的警告，這個怪物是當年被「魔斯拉」給封印的「蓋剛」，蓋剛的出現代表著人類...